土壤调理剂可针对棚室中出现的土壤酸化、盐渍化、板结的情况进行改善。因此一旦发现土壤出现问题就须立即使用，才能及时将土壤调理至健康状态。所以，土壤调理剂并不是任何时候都可以使用的。而在使用土壤调理剂时应注意以下几个问题：
首先，确定土壤已经出现了恶化的情况。在蔬菜种植过程中，生长出现问题并不一定代表土壤已经恶化。了解和判断土壤是否有恶化的趋向或者已经恶化就必须通过正规的检测部门对土壤进行检测才行。当检测结果不适宜蔬菜生长的时候，就应该使用相应的土壤调理剂进行适当的调理，将土壤各项指标恢复到正常的范围内。而当我们看到土壤已经明显表现出红白霜、板结的情况时，说明土壤恶化的问题已经很严重了，此时应立即使用土壤调理剂进行调整。
其次，不能长期依赖使用，避免调节过度。土壤调理剂的主要作用是改良土壤的偏酸、偏碱、盐渍化以及板结状态，因此不能长期使用，否则会导致过度矫正而更不利于蔬菜生长。因此，土壤调理剂应根据不同的恶化情况使用不同的数量及次数。而对于市场上的一些以调理剂为主，添加了其他养分（如有益菌、海藻酸、腐殖酸等）的复合肥料可适当延长使用次数。
再次，正确使用土壤调理剂产品可快速改良恶化土壤。以土壤疏松及免深耕调理剂为例。它需要根据不同的土质类型来掌握正确的用量。对于土块板结、粘性大、水肥分布不均、耕作层较浅的土壤，每年使用2次，以后逐年减少用量直至不施。在使用时一定要正确掌握用量，用量过低难以达到改良效果；用量过高或施用次数过多，则会造成浪费。水是土壤免耕剂的生物活性载体，如果土壤里没有充分湿润的水分，免耕剂的生物活性就不能激活。因此，使用土壤疏松及免深耕调理剂以后要保持土壤有一定的湿度。
第三、不建议使用水泥、生石灰来调节土壤的pH值。有些菜农选择水泥、生石灰作为调理剂改良土壤化学性状。如果土壤严重酸化，使用水泥、生石灰后，当时pH值肯定会升高，表面上土壤酸化已经得到解决。这种做法的弊端是无法解决盐渍化，同时严重破坏土壤结构，形成沉淀，导致土壤恶化加重。
最后，提醒广大菜农，日常栽培应注意合理使用各类肥料，避免土壤出现恶化。土壤出现问题以后要合理使用土壤调理剂结合有机肥、生物肥、土杂肥、农家肥、秸秆还田，合理使用化肥，并结合土壤深翻等等综合措施，使土壤快速脱离不健康状态，恢复土壤良好功能，才能为我们现代农业的健康持续发展打下良好的基础
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